Ortalığı karıştıracak çalışma! Koronavirüs pandemisinin kaynağı mı bulundu?

Dünyayı etkisi altına alınan yeni tip koronavirüs salgının kaynağı tam bir muamma. Bugüne kadar onlarca iddia ileri sürüldü. Çin’de iki araştırmacının bu salgının kökenini inceleyen çalışması virüsün nasıl ortaya çıktığına ilişkin sorulara yanıt olabilir.

Prof. Dr. Gülümser Heper
VERYANSIN TV

Çin’de Koronavirüsün ilk nasıl yayıldığına ilişkin yapılan çalışma bulundu. Veryansın Tv yazarı ve Tıp doktoru Prof. Dr. Gülümser Heper’in bulduğu bilimsel çalışmada, Koronavirüs pandemisinin kaynağı açıklanıyor.

Güney Çin Teknoloji Üniversitesinden Botao Xiao ve Wuhan Bilim ve Teknoloji Üniversitesinden Lei Xiao adlı iki araştırmacının çalışmasında dünyayı sarsan 2019-nCorona Virüs pandemisiyle ilgili çarpıcı bilgiler veriliyor.

İlgili makalenin yayınlandığı yerden geri çekildiği ancak bir zaman sonra bir şekilde sızdığı öğrenildi.

Prof. Dr. Gülümser Heper, Veryansın Tv okuyucuları için dikkat çeken yazıyı birebir çevirdi.

İşte makalenin çevirisi ve orijinali:

Şekil 1. Epideminin kaynağı Huanan Deniz Ürünleri marketinin WHCDC (Wuhan Hastalık Kontrol ve Engelleme Merkezi) ile konumsal ilişkisi.

Çalışmanın 1. Otörü Botao Xiao

2019-nCoV Salgınının Muhtemel Nedenleri

Botao Xiao (1,2) ve Lei Xiao (3)

1 Joint International Research Laboratory of Synthetic Biology and Medicine, School of Biology and Biological Engineering, South China University of Technology, Guangzhou 510006, China

2 School of Physics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China

3 Tian You Hospital, Wuhan University of Science and Technology, Wuhan 430064, China * Corresponding author: [email protected] Tel / Fax: 86-20-3938-0631

2019-nCoV 6 Şubat 2020 tarihi itibariyle 564 ölüm ve 28,060 kişide hastalık yaratan bir salgına neden oldu. Nature dergisinde bu hafta yayınlanan makalede, hastalardan alınan örneklerdeki virüsün genetik yapısının tanımı, Rhinolophus affinis ailesinden olan Bat (yarasa) CoV ZC45 koronavirus ile %89 ile %96 oranında uyumluydu. 1,2

Bu patojenlerin nereden geldiği ve insana nasıl geçtiğini çalışmak kritik önemlilikteydi. Lancet dergisinde yayınlanan bir makale, Wuhan’da 41 kişide akut solunum yetmezliği tanımlıyordu ve bunların 27’sinin Wuhan’daki deniz ürünleri pazarı ile bağlantısı vardı.3. Salgın sonrası marketten alınan 585 örneğin, 33’ünde Bat CoV ZC45 koronavirus tespit edildi.

Market, epideminin kaynağı olarak şüphelenildi ve hükümet kararları gerekçesiyle karantina tedbirleri kapsamında kapatıldı. Bat CoV ZC45 koronavirusü taşıyan yarasalar orijinal olarak, Zhejiang eyaletine bağlı Yunnan’da tespit edildi; her iki bölge de deniz ürünleri marketinden 900 km uzakta idi. Yunnan’daki bu yarasalar, normalde mağaralarda ve ağaçlarda yaşarlar. Deniz ürünleri marketi, Wuhan’da yoğun popülasyonu olan bir bölgededir; 15 milyon kişinin yaşadığı bir bölgedir. Yunnan’da bulunan bu yarasaların marketin olduğu bölgeye 900 km uçması doğal değildir.

Belediye yetkililerinden, markette çalışanlardan ve ziyaretçilerden alınan bilgilere göre, yarasalar şehirde gıda kaynağı olarak kullanılmaz ve marketlerde satılmaz. Coronavirüsün muhtemel aracı veya doğal konağı olması gerekliydi ve henüz ispatlanan bir şey yoktu. Peki başka bir muhtemel yol var mıydı?

Biz, deniz ürünleri marketinin yakınlarını taradık ve tam iki tane yarasa koronavirüsleri çalışan laboratuvar tespit ettik. Marketin 280 metre uzağında The Wuhan Center for Disease Control & Prevention (WHCDC) merkezi vardı (Şekil 1; Baidu ve Google haritalarından alınmıştır). WHCDC nin ev sahipliği yaptığı ve laboratuvar çalışması amaçlı kullandığı hayvanlarda spesifik olarak patojenler toplanıyor ve çeşidi tespit ediliyordu. 4-6. Onların çalışmalarının birinde, Rhinolophus affinis ailesini ihtiva eden 155 yarasanın Hubei bölgesinden yakalanıp ve kullanıldığı belirtiliyordu; 450 yarasa ise Zhejiang eyaletinden yakalanmıştı.4. Yarasa toplama işini yapan kişi (JHT isimli dergide yayınlanırken), makaleye katkıda bulunanlar olarak belirtilmişti. Üstelik, toplama işini yapan kişiden, 2017 ve 2019 tarihli Çin Ulusal bazlı gazetelerde ve sitelerde bahsedilmişti. Kişi, toplama işini nasıl yaptığını anlatırken, yarasalar tarafından saldırıya uğradığını ve yarasanın kanının derisine bulaştığından bahsediyordu. Kişi, bu saldırının kendinde enfeksiyon riski oluşturması nedeniyle hastalık kapma riskinden bahsediyor ve kendisini 14 gün karantinaya aldığını söylüyordu.7. Bir başka kazada ise yarasalar kendisini ısırdığı için, yeniden kendisini karantinaya aldığını söylüyordu. Bir keresinde üzerinde canlı bir kene taşıyan bir yarasayı yakaladığı için heyecanlandığını söylüyordu.8.

Daha sonra kafesteki hayvanlara, cerrahi işlem uygulandı ve DNA ve RNA ektraksiyonu ve zincirini tespit etmek için hayvanlardan doku örnekleri alındı. 4-5. Alınan doku örnekleri ve bulaşlı çöp sepetleri, patojenleri içeriyordu. Bu kaynaklar deniz ürünleri marketinden sadece 280 metre uzaklıkta idi. WHCDC aynı zamanda The Union Hospital’e (Birlik Hastanesi) bitişikti; ki epidemide ilk hastalanan doktorlar bu hastanede çalışıyordu (Resim 1; altta). Muhtemel ki virüs etrafa yayılmış ve epidemide ilk hasta olanlara bulaşmıştı; bu tezlerin ispatı için ileri çalışma gereklidir.

İkinci laboratuvar, deniz ürünleri marketinden 12 km uzaktaydı ve Chinese Academy of Sciences’ın (Çin Akademik Bilimler) Viroloji laboratuvarıydı. 1,9,10. Bu laboratuvarın verilerine göre, Çin horseshoe yarasaları Şiddetli Akut Solunum Yetmezliği Sendromu Coronavirüs (SARS-CoV) nun doğal kaynağıydı. Bu virüsler, 2002-3 yıllarında SARS pandemisi yaratmıştı. 9. Projeye katılan temel araştırmacı, SARS-CoV reverse genetik yapısını kullanarak bir şimerik (kombine) virüs yaratmıştı ve bu virüsün insanda yaratacağı potansiyel hastalığı bildirmişti. 10. Doğrudan bir spekülasyon, SARS-CoV veya derivelerinin laboratuvardan sızması üzerineydi.

Sonuç olarak, birisi 2019-nCorona Virüsün evrimleşmesini sağladı. Doğal kaynaklarının ve aracılarının kaynağına ilaveten, öldürücü koronavirüs Wuhan’daki laboratuvardan muhtemelen dışarı sızdı. Yüksek riskli biyoloji laboratuvarlarında güvenlik seviyelerinin yeniden gözden geçirilmesi gerekebilir. Laboratuvarın yeri şehir merkezlerinden ve kalabalık bölgelerden ayrılmalı, yeni bir lokasyon belirlenmelidir.

Katkıda bulunan BX, literatür araştırmasını yaptı ve yorumları düzenledi. Bütün otörler, veri toplama ve analiz, belge toplanması, şekillerin çizilmesi ve makalenin yazılmasına katkıda bulundu. Açıklama: Bu çalışma, National Natural Science Foundation of China (11772133, 11372116) tarafından desteklendi. Otörlerin bir çıkar çelişkisi olmadığını beyan ederiz.

Kaynaklar:

1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140- 6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China’s future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.

The possible origins of 2019-nCoV coronavirus

Botao Xiao1,2* and Lei Xiao3

1 Joint International Research Laboratory of Synthetic Biology and Medicine, School of Biology and Biological Engineering, South China University of Technology, Guangzhou 510006, China

2 School of Physics, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430074, China

3 Tian You Hospital, Wuhan University of Science and Technology, Wuhan 430064, China * Corresponding author: [email protected] Tel / Fax: 86-20-3938-0631

The 2019-nCoV coronavirus has caused an epidemic of 28,060 laboratory-confirmed infections in human including 564 deaths in China by February 6, 2020. Two descriptions of the virus published on Nature this week indicated that the genome sequences from patients were 96% or 89% identical to the Bat CoV ZC45 coronavirus originally found in Rhinolophus affinis 1,2.

It was critical to study where the pathogen came from and how it passed onto human. An article published on The Lancet reported that 41 people in Wuhan were found to have the acute respiratory syndrome and 27 of them had contact with Huanan Seafood Market 3. Bat CoV ZC45 coronavirus was found in 33 out of 585 samples collected in the market after the outbreak.

The market was suspicious to be the origin of the epidemic, and was shut down according to the rule of quarantine the source during an epidemic. The bats carrying Bat CoV ZC45 coronavirus were originally found in Yunnan or Zhejiang province, both of which were more than 900 kilometers away from the seafood market. Bats were normally found to live in caves and trees. But the seafood market is in a densely-populated district of Wuhan, a metropolitan of ~15 million people. The probability was very low for the bats to fly to the market. According to municipal reports and the testimonies of 31 residents and 28 visitors, the bat was never a food source in the city, and no bat was traded in the market. There was possible natural recombination or intermediate host of the coronavirus, yet little proof has been reported.

Was there any other possible pathway? We screened the area around the seafood market and identified two laboratories conducting research on bat coronavirus. Within ~280 meters from the market, there was the Wuhan Center for Disease Control & Prevention (WHCDC) (Figure 1, from Baidu and Google maps). WHCDC hosted animals in laboratories for research purpose, one of which was specialized in pathogens collection and identification 4- 6. In one of their studies, 155 bats including Rhinolophus affinis were captured in Hubei province, and other 450 bats were captured in Zhejiang province 4. The expert in collection was noted in the Author Contributions (JHT). Moreover, he was broadcasted for collecting viruses on nation-wide newspapers and websites in 2017 and 2019 7,8. He described that he was once by attacked by bats and the blood of a bat shot on his skin. He knew the extreme danger of the infection so he quarantined himself for 14 days 7. In another accident, he quarantined himself again because bats peed on him. He was once thrilled for capturing a bat carrying a live tick 8. Surgery was performed on the caged animals and the tissue samples were collected for DNA and RNA extraction and sequencing 4, 5. The tissue samples and contaminated trashes were source of pathogens. They were only ~280 meters from the seafood market. The WHCDC was also adjacent to the Union Hospital (Figure 1, bottom) where the first group of doctors were infected during this epidemic. It is plausible that the virus leaked around and some of them contaminated the initial patients in this epidemic, though solid proofs are needed in future study.

The second laboratory was ~12 kilometers from the seafood market and belonged to Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences 1, 9, 10. This laboratory reported that the Chinese horseshoe bats were natural reservoirs for the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) which caused the 2002-3 pandemic 9. The principle investigator participated in a project which generated a chimeric virus using the SARS-CoV reverse genetics system, and reported the potential for human emergence 10. A direct speculation was that SARS-CoV or its derivative might leak from the laboratory. In summary, somebody was entangled with the evolution of 2019-nCoV coronavirus. In addition to origins of natural recombination and intermediate host, the killer coronavirus probably originated from a laboratory in Wuhan. Safety level may need to be reinforced in high risk biohazardous laboratories. Regulations may be taken to relocate these laboratories far away from city center and other densely populated places.

Contributors BX designed the comment and performed literature search. All authors performed data acquisition and analysis, collected documents, draw the figure, and wrote the papers. Acknowledgements This work is supported by the National Natural Science Foundation of China (11772133, 11372116). Declaration of interests All authors declare no competing interests.

References

1. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
2. Wu F, Zhao S, Yu B, et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3.
3. Huang C, Wang Y, Li X, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet 2019. https://doi.org/10.1016/S0140- 6736(20)30183-5.
4. Guo WP, Lin XD, Wang W, et al. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS pathogens 2013; 9(2): e1003159.
5. Lu M, Tian JH, Yu B, Guo WP, Holmes EC, Zhang YZ. Extensive diversity of rickettsiales bacteria in ticks from Wuhan, China. Ticks and tick-borne diseases 2017; 8(4): 574-80.
6. Shi M, Lin XD, Chen X, et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature 2018; 556(7700): 197-202.
7. Tao P. Expert in Wuhan collected ten thousands animals: capture bats in mountain at night. Changjiang Times 2017.
8. Li QX, Zhanyao. Playing with elephant dung, fishing for sea bottom mud: the work that will change China’s future. thepaper 2019.
9. Ge XY, Li JL, Yang XL, et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 2013; 503(7477): 535-8.
10. Menachery VD, Yount BL, Jr., Debbink K, et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature medicine 2015; 21(12): 1508-13.